Logeco è stata fondata all'inizio del 2019 con l'obiettivo di rispondere alle crescenti esigenze dei servizi legati al settore dei trasporti. Nei primi mesi di attività, l'azienda ha firmato due contratti per il noleggio di container ferroviari e di escavatori.
Nel 2020, durante il periodo di riduzione del lavoro dovuto al Covid, Logeco ha colto un'opportunità di mercato acquistando un'area da destinare a sede logistica. Una volta completata all'inizio del 2023, la maggior parte di questa è stata affittata mantenendone una parte per se come sede operativa.
Dalla fine del 2023, l'azienda ha rinnovato la sua concentrazione sul core business chiudendo importanti contratti legati al trasporti intermodali dei rifiuti.